Генеральной линией деятельности ФГУП «ВНИИФТРИ» является хранение, эксплуатация и совершенствование эталонной базы.

На сегодняшний день во ВНИИФТРИ хранятся и эксплуатируются около 35 % всех государственных первичных эталонов Российской Федерации. Эталонная база ВНИИФТРИ включает в себя 55 Государственных первичных эталонов и более 300 вторичных и рабочих эталонов. Два эталона института воспроизводят размеры основных единиц СИ — секунды и кельвина.

Эталонная база непрерывно совершенствуется в соответствии с актуальными потребностями страны в единстве измерений. Разрабатываются новые и модернизируются существующие Государственные первичные и вторичные эталоны. Эталоны института успешно проходят ключевые международные и региональные сличения.